Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
GOLGA3Q08378 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GOLGA3Q08378 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms