Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SOX4Q06945 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms