Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBQ06643 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBQ06643 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBQ06643 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBQ06643 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LTBQ06643 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LTBQ06643 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LTBQ06643 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LTBQ06643 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LTBQ06643 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBQ06643 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBQ06643 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBQ06643 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBQ06643 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBQ06643 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBQ06643 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBQ06643 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBQ06643 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBQ06643 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBQ06643 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBQ06643 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBQ06643 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBQ06643 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBQ06643 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBQ06643 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBQ06643 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBQ06643 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBQ06643 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBQ06643 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBQ06643 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBQ06643 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBQ06643 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBQ06643 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBQ06643 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBQ06643 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBQ06643 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBQ06643 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBQ06643 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBQ06643 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBQ06643 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LTBQ06643 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBQ06643 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBQ06643 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBQ06643 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBQ06643 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBQ06643 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBQ06643 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBQ06643 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBQ06643 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBQ06643 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBQ06643 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBQ06643 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBQ06643 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBQ06643 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBQ06643 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBQ06643 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBQ06643 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBQ06643 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBQ06643 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBQ06643 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBQ06643 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBQ06643 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBQ06643 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBQ06643 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBQ06643 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBQ06643 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBQ06643 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBQ06643 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBQ06643 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBQ06643 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBQ06643 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBQ06643 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBQ06643 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBQ06643 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBQ06643 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LTBQ06643 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBQ06643 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBQ06643 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBQ06643 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBQ06643 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBQ06643 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBQ06643 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBQ06643 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBQ06643 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBQ06643 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBQ06643 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBQ06643 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBQ06643 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBQ06643 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBQ06643 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBQ06643 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBQ06643 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBQ06643 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBQ06643 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBQ06643 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBQ06643 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBQ06643 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBQ06643 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBQ06643 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LTBQ06643 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms