Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms