Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms