Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
MS4A2Q01362 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MS4A2Q01362 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms