Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F1Q01094 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms