Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG7P83436 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG7P83436 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG7P83436 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG7P83436 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG7P83436 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG7P83436 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG7P83436 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG7P83436 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG7P83436 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
COG7P83436 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG7P83436 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG7P83436 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG7P83436 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG7P83436 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG7P83436 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG7P83436 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COG7P83436 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG7P83436 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG7P83436 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG7P83436 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG7P83436 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG7P83436 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG7P83436 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG7P83436 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG7P83436 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG7P83436 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG7P83436 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG7P83436 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG7P83436 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG7P83436 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG7P83436 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG7P83436 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG7P83436 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
COG7P83436 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG7P83436 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG7P83436 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG7P83436 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG7P83436 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG7P83436 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG7P83436 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG7P83436 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG7P83436 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG7P83436 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COG7P83436 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
COG7P83436 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
COG7P83436 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
COG7P83436 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG7P83436 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG7P83436 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
COG7P83436 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG7P83436 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG7P83436 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG7P83436 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG7P83436 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG7P83436 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
COG7P83436 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG7P83436 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG7P83436 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG7P83436 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG7P83436 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG7P83436 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG7P83436 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG7P83436 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG7P83436 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG7P83436 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG7P83436 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG7P83436 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COG7P83436 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG7P83436 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG7P83436 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG7P83436 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG7P83436 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG7P83436 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG7P83436 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG7P83436 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG7P83436 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG7P83436 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG7P83436 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG7P83436 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG7P83436 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG7P83436 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG7P83436 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG7P83436 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG7P83436 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG7P83436 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG7P83436 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG7P83436 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG7P83436 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
COG7P83436 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
COG7P83436 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG7P83436 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG7P83436 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG7P83436 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG7P83436 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG7P83436 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
COG7P83436 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG7P83436 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG7P83436 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COG7P83436 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms