Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMF1P82094 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMF1P82094 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMF1P82094 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMF1P82094 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMF1P82094 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMF1P82094 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMF1P82094 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMF1P82094 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMF1P82094 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMF1P82094 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMF1P82094 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMF1P82094 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMF1P82094 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMF1P82094 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMF1P82094 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMF1P82094 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMF1P82094 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMF1P82094 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
TMF1P82094 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMF1P82094 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMF1P82094 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMF1P82094 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMF1P82094 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMF1P82094 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMF1P82094 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TMF1P82094 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMF1P82094 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMF1P82094 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMF1P82094 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMF1P82094 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMF1P82094 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMF1P82094 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TMF1P82094 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMF1P82094 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMF1P82094 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMF1P82094 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMF1P82094 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMF1P82094 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMF1P82094 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMF1P82094 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMF1P82094 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMF1P82094 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMF1P82094 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TMF1P82094 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMF1P82094 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMF1P82094 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TMF1P82094 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TMF1P82094 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMF1P82094 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMF1P82094 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMF1P82094 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMF1P82094 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMF1P82094 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMF1P82094 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMF1P82094 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMF1P82094 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMF1P82094 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMF1P82094 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMF1P82094 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMF1P82094 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMF1P82094 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMF1P82094 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TMF1P82094 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMF1P82094 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMF1P82094 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMF1P82094 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TMF1P82094 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMF1P82094 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMF1P82094 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMF1P82094 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMF1P82094 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMF1P82094 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMF1P82094 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TMF1P82094 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMF1P82094 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMF1P82094 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMF1P82094 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMF1P82094 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMF1P82094 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMF1P82094 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMF1P82094 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMF1P82094 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMF1P82094 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMF1P82094 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TMF1P82094 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMF1P82094 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMF1P82094 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMF1P82094 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMF1P82094 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TMF1P82094 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMF1P82094 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMF1P82094 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMF1P82094 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMF1P82094 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMF1P82094 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMF1P82094 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMF1P82094 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMF1P82094 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMF1P82094 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms