Protein–RNA interactions for Protein: P80192

MAP3K9, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K9P80192 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MAP3K9P80192 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MAP3K9P80192 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MAP3K9P80192 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MAP3K9P80192 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MAP3K9P80192 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MAP3K9P80192 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MAP3K9P80192 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MAP3K9P80192 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MAP3K9P80192 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MAP3K9P80192 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MAP3K9P80192 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MAP3K9P80192 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MAP3K9P80192 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MAP3K9P80192 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MAP3K9P80192 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MAP3K9P80192 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MAP3K9P80192 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MAP3K9P80192 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MAP3K9P80192 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MAP3K9P80192 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MAP3K9P80192 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MAP3K9P80192 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MAP3K9P80192 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MAP3K9P80192 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MAP3K9P80192 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MAP3K9P80192 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MAP3K9P80192 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MAP3K9P80192 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MAP3K9P80192 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MAP3K9P80192 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MAP3K9P80192 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MAP3K9P80192 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MAP3K9P80192 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MAP3K9P80192 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MAP3K9P80192 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MAP3K9P80192 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MAP3K9P80192 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MAP3K9P80192 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MAP3K9P80192 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MAP3K9P80192 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MAP3K9P80192 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms