Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UFM1P61960 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UFM1P61960 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UFM1P61960 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UFM1P61960 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UFM1P61960 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UFM1P61960 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UFM1P61960 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UFM1P61960 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UFM1P61960 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UFM1P61960 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UFM1P61960 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UFM1P61960 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UFM1P61960 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UFM1P61960 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UFM1P61960 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UFM1P61960 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UFM1P61960 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UFM1P61960 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UFM1P61960 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UFM1P61960 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UFM1P61960 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UFM1P61960 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UFM1P61960 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UFM1P61960 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UFM1P61960 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UFM1P61960 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UFM1P61960 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UFM1P61960 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UFM1P61960 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UFM1P61960 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UFM1P61960 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UFM1P61960 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UFM1P61960 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UFM1P61960 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UFM1P61960 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UFM1P61960 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UFM1P61960 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UFM1P61960 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UFM1P61960 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UFM1P61960 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UFM1P61960 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UFM1P61960 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UFM1P61960 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UFM1P61960 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UFM1P61960 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UFM1P61960 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UFM1P61960 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UFM1P61960 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UFM1P61960 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UFM1P61960 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UFM1P61960 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UFM1P61960 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UFM1P61960 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UFM1P61960 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UFM1P61960 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UFM1P61960 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UFM1P61960 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UFM1P61960 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UFM1P61960 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
UFM1P61960 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UFM1P61960 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
UFM1P61960 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
UFM1P61960 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UFM1P61960 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UFM1P61960 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UFM1P61960 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UFM1P61960 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UFM1P61960 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UFM1P61960 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UFM1P61960 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UFM1P61960 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UFM1P61960 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UFM1P61960 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UFM1P61960 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UFM1P61960 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UFM1P61960 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UFM1P61960 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UFM1P61960 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UFM1P61960 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UFM1P61960 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UFM1P61960 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UFM1P61960 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UFM1P61960 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UFM1P61960 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UFM1P61960 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UFM1P61960 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UFM1P61960 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UFM1P61960 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UFM1P61960 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
UFM1P61960 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UFM1P61960 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UFM1P61960 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UFM1P61960 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UFM1P61960 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UFM1P61960 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UFM1P61960 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UFM1P61960 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UFM1P61960 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UFM1P61960 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms