Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVS71-1P61550 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms