Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SPCS3P61009 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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SPCS3P61009 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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SPCS3P61009 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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SPCS3P61009 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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SPCS3P61009 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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SPCS3P61009 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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SPCS3P61009 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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SPCS3P61009 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPCS3P61009 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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