Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNAP25P60880 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SNAP25P60880 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms