Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ERVFC1P60507 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ERVFC1P60507 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVFC1P60507 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVFC1P60507 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVFC1P60507 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVFC1P60507 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVFC1P60507 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVFC1P60507 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVFC1P60507 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVFC1P60507 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVFC1P60507 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVFC1P60507 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVFC1P60507 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVFC1P60507 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVFC1P60507 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVFC1P60507 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVFC1P60507 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVFC1P60507 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVFC1P60507 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVFC1P60507 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVFC1P60507 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVFC1P60507 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVFC1P60507 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVFC1P60507 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVFC1P60507 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVFC1P60507 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVFC1P60507 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVFC1P60507 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVFC1P60507 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVFC1P60507 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVFC1P60507 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVFC1P60507 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVFC1P60507 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVFC1P60507 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVFC1P60507 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVFC1P60507 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVFC1P60507 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVFC1P60507 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVFC1P60507 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms