Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC00313P59037 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms