Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF3P57682 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF3P57682 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF3P57682 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF3P57682 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF3P57682 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF3P57682 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF3P57682 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF3P57682 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF3P57682 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF3P57682 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF3P57682 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF3P57682 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF3P57682 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF3P57682 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF3P57682 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF3P57682 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF3P57682 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF3P57682 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF3P57682 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF3P57682 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF3P57682 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF3P57682 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF3P57682 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF3P57682 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF3P57682 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF3P57682 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF3P57682 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF3P57682 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF3P57682 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF3P57682 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF3P57682 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF3P57682 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF3P57682 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF3P57682 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF3P57682 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF3P57682 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF3P57682 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF3P57682 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF3P57682 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF3P57682 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF3P57682 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF3P57682 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF3P57682 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF3P57682 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF3P57682 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF3P57682 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF3P57682 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF3P57682 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF3P57682 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF3P57682 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF3P57682 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF3P57682 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF3P57682 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF3P57682 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF3P57682 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF3P57682 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF3P57682 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF3P57682 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF3P57682 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF3P57682 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF3P57682 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF3P57682 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF3P57682 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF3P57682 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF3P57682 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF3P57682 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF3P57682 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF3P57682 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF3P57682 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF3P57682 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF3P57682 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF3P57682 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF3P57682 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF3P57682 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF3P57682 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF3P57682 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF3P57682 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF3P57682 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF3P57682 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF3P57682 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF3P57682 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF3P57682 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF3P57682 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF3P57682 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF3P57682 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF3P57682 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF3P57682 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF3P57682 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF3P57682 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF3P57682 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF3P57682 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF3P57682 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF3P57682 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLF3P57682 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLF3P57682 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
KLF3P57682 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLF3P57682 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF3P57682 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF3P57682 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms