Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HK3P52790 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HK3P52790 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HK3P52790 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HK3P52790 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HK3P52790 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HK3P52790 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HK3P52790 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HK3P52790 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HK3P52790 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HK3P52790 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HK3P52790 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HK3P52790 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HK3P52790 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HK3P52790 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HK3P52790 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HK3P52790 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HK3P52790 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HK3P52790 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HK3P52790 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HK3P52790 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HK3P52790 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HK3P52790 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HK3P52790 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HK3P52790 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HK3P52790 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HK3P52790 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HK3P52790 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HK3P52790 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HK3P52790 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HK3P52790 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HK3P52790 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HK3P52790 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HK3P52790 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HK3P52790 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HK3P52790 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HK3P52790 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HK3P52790 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HK3P52790 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HK3P52790 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HK3P52790 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HK3P52790 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HK3P52790 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HK3P52790 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HK3P52790 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HK3P52790 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HK3P52790 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HK3P52790 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HK3P52790 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HK3P52790 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HK3P52790 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HK3P52790 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HK3P52790 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HK3P52790 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HK3P52790 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HK3P52790 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HK3P52790 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HK3P52790 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HK3P52790 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HK3P52790 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HK3P52790 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HK3P52790 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HK3P52790 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HK3P52790 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HK3P52790 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HK3P52790 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HK3P52790 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HK3P52790 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HK3P52790 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HK3P52790 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HK3P52790 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HK3P52790 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HK3P52790 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HK3P52790 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HK3P52790 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HK3P52790 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HK3P52790 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HK3P52790 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HK3P52790 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HK3P52790 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HK3P52790 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HK3P52790 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HK3P52790 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HK3P52790 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HK3P52790 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HK3P52790 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HK3P52790 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HK3P52790 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HK3P52790 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HK3P52790 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HK3P52790 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HK3P52790 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HK3P52790 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HK3P52790 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HK3P52790 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HK3P52790 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HK3P52790 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HK3P52790 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HK3P52790 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HK3P52790 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms