Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
GTF2A2P52657 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2A2P52657 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms