Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PGDP52209 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PGDP52209 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PGDP52209 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGDP52209 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGDP52209 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGDP52209 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGDP52209 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGDP52209 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGDP52209 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGDP52209 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGDP52209 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGDP52209 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGDP52209 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGDP52209 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGDP52209 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGDP52209 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PGDP52209 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGDP52209 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGDP52209 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGDP52209 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGDP52209 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGDP52209 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGDP52209 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGDP52209 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGDP52209 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGDP52209 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PGDP52209 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PGDP52209 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PGDP52209 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PGDP52209 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGDP52209 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGDP52209 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PGDP52209 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PGDP52209 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PGDP52209 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PGDP52209 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGDP52209 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGDP52209 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGDP52209 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGDP52209 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGDP52209 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGDP52209 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGDP52209 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGDP52209 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGDP52209 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGDP52209 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGDP52209 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGDP52209 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGDP52209 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGDP52209 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGDP52209 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGDP52209 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGDP52209 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGDP52209 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGDP52209 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGDP52209 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PGDP52209 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGDP52209 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGDP52209 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGDP52209 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGDP52209 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGDP52209 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PGDP52209 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PGDP52209 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGDP52209 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGDP52209 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGDP52209 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGDP52209 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGDP52209 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGDP52209 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGDP52209 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGDP52209 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGDP52209 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGDP52209 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGDP52209 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGDP52209 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGDP52209 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGDP52209 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGDP52209 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGDP52209 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGDP52209 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGDP52209 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGDP52209 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGDP52209 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGDP52209 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGDP52209 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGDP52209 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGDP52209 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGDP52209 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGDP52209 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PGDP52209 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PGDP52209 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGDP52209 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGDP52209 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGDP52209 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGDP52209 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGDP52209 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PGDP52209 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PGDP52209 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms