Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ETV1P50549 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV1P50549 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV1P50549 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV1P50549 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV1P50549 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV1P50549 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV1P50549 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV1P50549 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV1P50549 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV1P50549 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV1P50549 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV1P50549 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV1P50549 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV1P50549 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV1P50549 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV1P50549 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV1P50549 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV1P50549 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV1P50549 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV1P50549 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV1P50549 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV1P50549 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV1P50549 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV1P50549 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV1P50549 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV1P50549 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV1P50549 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV1P50549 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV1P50549 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV1P50549 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV1P50549 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV1P50549 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV1P50549 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV1P50549 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV1P50549 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV1P50549 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV1P50549 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV1P50549 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV1P50549 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV1P50549 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV1P50549 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ETV1P50549 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ETV1P50549 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ETV1P50549 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ETV1P50549 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ETV1P50549 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ETV1P50549 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ETV1P50549 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ETV1P50549 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ETV1P50549 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ETV1P50549 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ETV1P50549 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ETV1P50549 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ETV1P50549 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ETV1P50549 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ETV1P50549 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ETV1P50549 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ETV1P50549 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ETV1P50549 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ETV1P50549 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ETV1P50549 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ETV1P50549 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ETV1P50549 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ETV1P50549 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ETV1P50549 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ETV1P50549 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ETV1P50549 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ETV1P50549 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ETV1P50549 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ETV1P50549 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ETV1P50549 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ETV1P50549 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ETV1P50549 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ETV1P50549 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ETV1P50549 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ETV1P50549 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ETV1P50549 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ETV1P50549 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ETV1P50549 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ETV1P50549 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ETV1P50549 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ETV1P50549 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ETV1P50549 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ETV1P50549 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ETV1P50549 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ETV1P50549 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ETV1P50549 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ETV1P50549 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ETV1P50549 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ETV1P50549 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ETV1P50549 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ETV1P50549 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ETV1P50549 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ETV1P50549 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ETV1P50549 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ETV1P50549 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ETV1P50549 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ETV1P50549 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ETV1P50549 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms