Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTPAP49638 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTPAP49638 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTPAP49638 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTPAP49638 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTPAP49638 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTPAP49638 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTPAP49638 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTPAP49638 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTPAP49638 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTPAP49638 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TTPAP49638 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TTPAP49638 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TTPAP49638 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TTPAP49638 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTPAP49638 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTPAP49638 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTPAP49638 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTPAP49638 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTPAP49638 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTPAP49638 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTPAP49638 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTPAP49638 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTPAP49638 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTPAP49638 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TTPAP49638 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTPAP49638 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTPAP49638 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTPAP49638 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTPAP49638 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTPAP49638 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTPAP49638 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTPAP49638 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTPAP49638 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTPAP49638 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TTPAP49638 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTPAP49638 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTPAP49638 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTPAP49638 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTPAP49638 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TTPAP49638 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTPAP49638 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTPAP49638 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TTPAP49638 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTPAP49638 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTPAP49638 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTPAP49638 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTPAP49638 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTPAP49638 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTPAP49638 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTPAP49638 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTPAP49638 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTPAP49638 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTPAP49638 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTPAP49638 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTPAP49638 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTPAP49638 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTPAP49638 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTPAP49638 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTPAP49638 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTPAP49638 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTPAP49638 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTPAP49638 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TTPAP49638 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTPAP49638 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TTPAP49638 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTPAP49638 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TTPAP49638 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTPAP49638 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTPAP49638 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TTPAP49638 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTPAP49638 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTPAP49638 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTPAP49638 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTPAP49638 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTPAP49638 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTPAP49638 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTPAP49638 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTPAP49638 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTPAP49638 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TTPAP49638 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TTPAP49638 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTPAP49638 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTPAP49638 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTPAP49638 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTPAP49638 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTPAP49638 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTPAP49638 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTPAP49638 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTPAP49638 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TTPAP49638 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTPAP49638 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTPAP49638 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTPAP49638 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTPAP49638 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTPAP49638 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTPAP49638 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TTPAP49638 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TTPAP49638 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TTPAP49638 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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