Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FNTAP49354 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FNTAP49354 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FNTAP49354 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FNTAP49354 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FNTAP49354 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FNTAP49354 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FNTAP49354 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FNTAP49354 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FNTAP49354 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FNTAP49354 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FNTAP49354 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FNTAP49354 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FNTAP49354 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FNTAP49354 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FNTAP49354 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FNTAP49354 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FNTAP49354 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FNTAP49354 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FNTAP49354 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FNTAP49354 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FNTAP49354 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FNTAP49354 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FNTAP49354 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FNTAP49354 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FNTAP49354 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FNTAP49354 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FNTAP49354 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FNTAP49354 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FNTAP49354 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTAP49354 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTAP49354 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTAP49354 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTAP49354 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTAP49354 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTAP49354 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTAP49354 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTAP49354 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTAP49354 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTAP49354 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTAP49354 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTAP49354 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTAP49354 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTAP49354 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTAP49354 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTAP49354 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTAP49354 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTAP49354 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTAP49354 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTAP49354 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTAP49354 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTAP49354 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTAP49354 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTAP49354 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTAP49354 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTAP49354 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTAP49354 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTAP49354 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTAP49354 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTAP49354 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTAP49354 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTAP49354 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNTAP49354 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FNTAP49354 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FNTAP49354 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FNTAP49354 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FNTAP49354 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FNTAP49354 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FNTAP49354 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FNTAP49354 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FNTAP49354 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FNTAP49354 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FNTAP49354 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FNTAP49354 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FNTAP49354 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FNTAP49354 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FNTAP49354 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FNTAP49354 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FNTAP49354 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FNTAP49354 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FNTAP49354 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FNTAP49354 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FNTAP49354 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FNTAP49354 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FNTAP49354 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FNTAP49354 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FNTAP49354 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FNTAP49354 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FNTAP49354 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FNTAP49354 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FNTAP49354 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FNTAP49354 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FNTAP49354 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FNTAP49354 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FNTAP49354 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FNTAP49354 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FNTAP49354 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FNTAP49354 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FNTAP49354 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FNTAP49354 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms