Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRPC1P48995 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms