Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms