Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD13P35453 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms