Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
THBS4P35443 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
THBS4P35443 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
THBS4P35443 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
THBS4P35443 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
THBS4P35443 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
THBS4P35443 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
THBS4P35443 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
THBS4P35443 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
THBS4P35443 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
THBS4P35443 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
THBS4P35443 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
THBS4P35443 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
THBS4P35443 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
THBS4P35443 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
THBS4P35443 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
THBS4P35443 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
THBS4P35443 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
THBS4P35443 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
THBS4P35443 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
THBS4P35443 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
THBS4P35443 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
THBS4P35443 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
THBS4P35443 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
THBS4P35443 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
THBS4P35443 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THBS4P35443 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THBS4P35443 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THBS4P35443 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THBS4P35443 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THBS4P35443 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THBS4P35443 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THBS4P35443 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THBS4P35443 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
THBS4P35443 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
THBS4P35443 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THBS4P35443 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THBS4P35443 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THBS4P35443 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THBS4P35443 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THBS4P35443 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THBS4P35443 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THBS4P35443 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
THBS4P35443 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
THBS4P35443 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THBS4P35443 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THBS4P35443 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THBS4P35443 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THBS4P35443 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THBS4P35443 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THBS4P35443 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THBS4P35443 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THBS4P35443 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THBS4P35443 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THBS4P35443 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THBS4P35443 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THBS4P35443 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
THBS4P35443 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
THBS4P35443 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THBS4P35443 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THBS4P35443 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
THBS4P35443 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THBS4P35443 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THBS4P35443 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THBS4P35443 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
THBS4P35443 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THBS4P35443 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THBS4P35443 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THBS4P35443 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THBS4P35443 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THBS4P35443 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THBS4P35443 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THBS4P35443 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THBS4P35443 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THBS4P35443 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
THBS4P35443 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THBS4P35443 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
THBS4P35443 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THBS4P35443 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THBS4P35443 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THBS4P35443 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THBS4P35443 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THBS4P35443 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THBS4P35443 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THBS4P35443 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
THBS4P35443 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THBS4P35443 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
THBS4P35443 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
THBS4P35443 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
THBS4P35443 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
THBS4P35443 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
THBS4P35443 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
THBS4P35443 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
THBS4P35443 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
THBS4P35443 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
THBS4P35443 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
THBS4P35443 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
THBS4P35443 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
THBS4P35443 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
THBS4P35443 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms