Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TSPOP30536 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TSPOP30536 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TSPOP30536 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TSPOP30536 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TSPOP30536 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TSPOP30536 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TSPOP30536 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TSPOP30536 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TSPOP30536 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TSPOP30536 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TSPOP30536 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TSPOP30536 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TSPOP30536 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TSPOP30536 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TSPOP30536 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TSPOP30536 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TSPOP30536 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TSPOP30536 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TSPOP30536 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TSPOP30536 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TSPOP30536 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TSPOP30536 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TSPOP30536 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TSPOP30536 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TSPOP30536 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TSPOP30536 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TSPOP30536 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TSPOP30536 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TSPOP30536 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TSPOP30536 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TSPOP30536 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TSPOP30536 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TSPOP30536 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TSPOP30536 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TSPOP30536 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TSPOP30536 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TSPOP30536 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TSPOP30536 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TSPOP30536 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TSPOP30536 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TSPOP30536 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TSPOP30536 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TSPOP30536 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TSPOP30536 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TSPOP30536 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TSPOP30536 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TSPOP30536 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TSPOP30536 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TSPOP30536 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TSPOP30536 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TSPOP30536 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TSPOP30536 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TSPOP30536 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TSPOP30536 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TSPOP30536 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TSPOP30536 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TSPOP30536 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TSPOP30536 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TSPOP30536 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TSPOP30536 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TSPOP30536 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TSPOP30536 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TSPOP30536 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TSPOP30536 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TSPOP30536 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TSPOP30536 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TSPOP30536 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TSPOP30536 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TSPOP30536 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TSPOP30536 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TSPOP30536 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TSPOP30536 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TSPOP30536 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TSPOP30536 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TSPOP30536 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TSPOP30536 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TSPOP30536 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TSPOP30536 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TSPOP30536 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TSPOP30536 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TSPOP30536 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TSPOP30536 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TSPOP30536 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TSPOP30536 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TSPOP30536 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TSPOP30536 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TSPOP30536 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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