Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD40LGP29965 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms