Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2E2P29084 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms