Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMBRP28336 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMBRP28336 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMBRP28336 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NMBRP28336 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMBRP28336 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMBRP28336 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMBRP28336 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMBRP28336 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMBRP28336 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMBRP28336 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMBRP28336 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMBRP28336 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMBRP28336 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMBRP28336 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NMBRP28336 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NMBRP28336 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NMBRP28336 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NMBRP28336 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMBRP28336 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMBRP28336 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMBRP28336 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMBRP28336 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMBRP28336 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMBRP28336 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMBRP28336 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMBRP28336 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMBRP28336 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NMBRP28336 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMBRP28336 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMBRP28336 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMBRP28336 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMBRP28336 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMBRP28336 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMBRP28336 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMBRP28336 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMBRP28336 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMBRP28336 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMBRP28336 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMBRP28336 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMBRP28336 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMBRP28336 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMBRP28336 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMBRP28336 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMBRP28336 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMBRP28336 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMBRP28336 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMBRP28336 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMBRP28336 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMBRP28336 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NMBRP28336 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMBRP28336 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMBRP28336 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMBRP28336 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMBRP28336 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMBRP28336 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMBRP28336 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMBRP28336 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMBRP28336 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMBRP28336 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMBRP28336 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMBRP28336 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMBRP28336 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMBRP28336 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMBRP28336 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMBRP28336 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMBRP28336 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMBRP28336 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMBRP28336 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NMBRP28336 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMBRP28336 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMBRP28336 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMBRP28336 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NMBRP28336 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMBRP28336 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMBRP28336 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMBRP28336 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMBRP28336 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMBRP28336 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMBRP28336 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NMBRP28336 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMBRP28336 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMBRP28336 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NMBRP28336 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMBRP28336 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMBRP28336 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NMBRP28336 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NMBRP28336 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMBRP28336 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMBRP28336 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NMBRP28336 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMBRP28336 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMBRP28336 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMBRP28336 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMBRP28336 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMBRP28336 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NMBRP28336 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMBRP28336 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMBRP28336 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NMBRP28336 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms