Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXP28300 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXP28300 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXP28300 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXP28300 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXP28300 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXP28300 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXP28300 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXP28300 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXP28300 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXP28300 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXP28300 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXP28300 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXP28300 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXP28300 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXP28300 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXP28300 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXP28300 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXP28300 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXP28300 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LOXP28300 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXP28300 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXP28300 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXP28300 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXP28300 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXP28300 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXP28300 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXP28300 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXP28300 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXP28300 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXP28300 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXP28300 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXP28300 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXP28300 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXP28300 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXP28300 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXP28300 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXP28300 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXP28300 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXP28300 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXP28300 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXP28300 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXP28300 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXP28300 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXP28300 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXP28300 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXP28300 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXP28300 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXP28300 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXP28300 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXP28300 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXP28300 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXP28300 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXP28300 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXP28300 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXP28300 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXP28300 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXP28300 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXP28300 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXP28300 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXP28300 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXP28300 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXP28300 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXP28300 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXP28300 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXP28300 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXP28300 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXP28300 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXP28300 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXP28300 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXP28300 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXP28300 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXP28300 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXP28300 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXP28300 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXP28300 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXP28300 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXP28300 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXP28300 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXP28300 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXP28300 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXP28300 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXP28300 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXP28300 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXP28300 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXP28300 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXP28300 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXP28300 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXP28300 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXP28300 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXP28300 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXP28300 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXP28300 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXP28300 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXP28300 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXP28300 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXP28300 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXP28300 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXP28300 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXP28300 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms