Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms