Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA1P25391 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms