Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF3P20783 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF3P20783 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF3P20783 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF3P20783 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF3P20783 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF3P20783 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF3P20783 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF3P20783 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF3P20783 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF3P20783 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF3P20783 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF3P20783 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF3P20783 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF3P20783 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF3P20783 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF3P20783 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF3P20783 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF3P20783 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF3P20783 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF3P20783 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF3P20783 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF3P20783 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF3P20783 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF3P20783 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF3P20783 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF3P20783 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF3P20783 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF3P20783 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF3P20783 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF3P20783 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF3P20783 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF3P20783 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF3P20783 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF3P20783 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF3P20783 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF3P20783 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF3P20783 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF3P20783 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF3P20783 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NTF3P20783 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NTF3P20783 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NTF3P20783 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NTF3P20783 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NTF3P20783 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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