Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TRHP20396 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRHP20396 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRHP20396 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TRHP20396 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TRHP20396 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TRHP20396 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TRHP20396 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TRHP20396 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRHP20396 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRHP20396 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRHP20396 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRHP20396 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRHP20396 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRHP20396 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRHP20396 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRHP20396 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRHP20396 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRHP20396 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TRHP20396 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRHP20396 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TRHP20396 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRHP20396 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRHP20396 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TRHP20396 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRHP20396 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRHP20396 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRHP20396 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRHP20396 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TRHP20396 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRHP20396 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRHP20396 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRHP20396 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRHP20396 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRHP20396 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRHP20396 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRHP20396 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TRHP20396 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRHP20396 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRHP20396 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRHP20396 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRHP20396 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRHP20396 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRHP20396 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRHP20396 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRHP20396 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRHP20396 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRHP20396 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRHP20396 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRHP20396 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TRHP20396 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRHP20396 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRHP20396 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRHP20396 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRHP20396 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRHP20396 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TRHP20396 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TRHP20396 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TRHP20396 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TRHP20396 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRHP20396 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRHP20396 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRHP20396 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TRHP20396 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRHP20396 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TRHP20396 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRHP20396 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRHP20396 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRHP20396 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRHP20396 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRHP20396 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRHP20396 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRHP20396 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRHP20396 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRHP20396 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRHP20396 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRHP20396 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TRHP20396 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRHP20396 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRHP20396 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRHP20396 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRHP20396 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRHP20396 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRHP20396 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRHP20396 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRHP20396 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TRHP20396 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TRHP20396 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRHP20396 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRHP20396 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRHP20396 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TRHP20396 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRHP20396 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRHP20396 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRHP20396 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRHP20396 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRHP20396 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRHP20396 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRHP20396 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRHP20396 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms