Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HLA-DPA1P20036 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms