Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF3P18847 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF3P18847 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF3P18847 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF3P18847 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF3P18847 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF3P18847 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF3P18847 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF3P18847 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF3P18847 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF3P18847 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF3P18847 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF3P18847 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF3P18847 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF3P18847 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF3P18847 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF3P18847 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF3P18847 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF3P18847 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF3P18847 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF3P18847 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF3P18847 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF3P18847 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF3P18847 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF3P18847 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF3P18847 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF3P18847 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF3P18847 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF3P18847 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF3P18847 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF3P18847 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF3P18847 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF3P18847 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF3P18847 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF3P18847 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF3P18847 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF3P18847 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATF3P18847 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATF3P18847 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATF3P18847 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATF3P18847 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATF3P18847 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATF3P18847 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATF3P18847 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATF3P18847 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF3P18847 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF3P18847 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF3P18847 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF3P18847 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF3P18847 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF3P18847 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF3P18847 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF3P18847 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF3P18847 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF3P18847 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF3P18847 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF3P18847 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF3P18847 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF3P18847 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF3P18847 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF3P18847 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF3P18847 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF3P18847 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF3P18847 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF3P18847 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF3P18847 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF3P18847 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF3P18847 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF3P18847 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF3P18847 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF3P18847 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF3P18847 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF3P18847 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF3P18847 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF3P18847 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF3P18847 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF3P18847 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF3P18847 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF3P18847 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF3P18847 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF3P18847 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF3P18847 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF3P18847 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF3P18847 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF3P18847 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF3P18847 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF3P18847 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF3P18847 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF3P18847 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF3P18847 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF3P18847 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF3P18847 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF3P18847 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF3P18847 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF3P18847 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF3P18847 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF3P18847 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF3P18847 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF3P18847 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATF3P18847 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms