Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHCEP18577 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHCEP18577 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHCEP18577 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHCEP18577 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHCEP18577 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHCEP18577 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHCEP18577 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHCEP18577 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHCEP18577 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHCEP18577 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHCEP18577 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHCEP18577 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHCEP18577 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHCEP18577 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHCEP18577 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHCEP18577 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHCEP18577 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHCEP18577 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHCEP18577 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHCEP18577 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHCEP18577 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHCEP18577 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHCEP18577 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHCEP18577 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHCEP18577 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHCEP18577 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHCEP18577 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHCEP18577 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHCEP18577 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHCEP18577 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHCEP18577 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHCEP18577 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHCEP18577 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHCEP18577 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHCEP18577 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHCEP18577 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHCEP18577 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHCEP18577 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHCEP18577 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHCEP18577 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHCEP18577 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHCEP18577 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHCEP18577 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHCEP18577 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHCEP18577 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHCEP18577 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RHCEP18577 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RHCEP18577 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RHCEP18577 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RHCEP18577 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHCEP18577 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHCEP18577 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHCEP18577 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHCEP18577 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHCEP18577 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHCEP18577 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHCEP18577 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHCEP18577 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHCEP18577 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHCEP18577 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHCEP18577 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHCEP18577 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHCEP18577 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHCEP18577 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHCEP18577 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHCEP18577 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHCEP18577 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHCEP18577 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHCEP18577 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHCEP18577 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHCEP18577 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHCEP18577 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RHCEP18577 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHCEP18577 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHCEP18577 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHCEP18577 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHCEP18577 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RHCEP18577 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHCEP18577 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RHCEP18577 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHCEP18577 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHCEP18577 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHCEP18577 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHCEP18577 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHCEP18577 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHCEP18577 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHCEP18577 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RHCEP18577 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHCEP18577 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHCEP18577 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHCEP18577 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHCEP18577 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHCEP18577 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHCEP18577 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHCEP18577 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHCEP18577 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHCEP18577 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHCEP18577 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHCEP18577 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms