Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ITGB4P16144 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB4P16144 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms