Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME1P15531 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME1P15531 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME1P15531 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NME1P15531 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME1P15531 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME1P15531 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME1P15531 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME1P15531 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME1P15531 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME1P15531 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NME1P15531 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME1P15531 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME1P15531 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME1P15531 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME1P15531 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME1P15531 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME1P15531 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME1P15531 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME1P15531 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NME1P15531 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME1P15531 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME1P15531 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME1P15531 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME1P15531 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME1P15531 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME1P15531 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NME1P15531 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME1P15531 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME1P15531 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME1P15531 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NME1P15531 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NME1P15531 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME1P15531 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NME1P15531 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME1P15531 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME1P15531 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME1P15531 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NME1P15531 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NME1P15531 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NME1P15531 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME1P15531 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME1P15531 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME1P15531 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME1P15531 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME1P15531 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME1P15531 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME1P15531 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME1P15531 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME1P15531 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME1P15531 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME1P15531 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME1P15531 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME1P15531 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME1P15531 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME1P15531 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NME1P15531 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME1P15531 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME1P15531 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME1P15531 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME1P15531 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME1P15531 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME1P15531 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME1P15531 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME1P15531 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME1P15531 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME1P15531 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME1P15531 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME1P15531 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME1P15531 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME1P15531 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME1P15531 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME1P15531 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME1P15531 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NME1P15531 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NME1P15531 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME1P15531 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NME1P15531 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME1P15531 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME1P15531 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME1P15531 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME1P15531 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME1P15531 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME1P15531 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME1P15531 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME1P15531 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME1P15531 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME1P15531 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NME1P15531 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME1P15531 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME1P15531 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME1P15531 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME1P15531 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME1P15531 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME1P15531 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME1P15531 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME1P15531 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME1P15531 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME1P15531 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NME1P15531 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms