Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms