Protein–RNA interactions for Protein: P14317

HCLS1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1P14317 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCLS1P14317 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms