Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACTN1P12814 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms