Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNB1P11230 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms