Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSP90AB1P08238 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms