Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOP08100 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOP08100 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOP08100 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOP08100 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOP08100 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOP08100 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOP08100 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOP08100 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOP08100 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOP08100 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOP08100 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOP08100 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOP08100 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOP08100 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOP08100 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOP08100 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOP08100 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOP08100 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOP08100 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOP08100 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOP08100 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOP08100 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOP08100 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOP08100 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOP08100 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOP08100 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOP08100 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOP08100 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOP08100 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOP08100 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOP08100 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOP08100 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOP08100 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOP08100 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOP08100 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOP08100 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOP08100 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOP08100 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOP08100 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOP08100 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOP08100 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOP08100 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOP08100 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOP08100 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOP08100 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOP08100 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOP08100 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOP08100 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOP08100 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOP08100 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOP08100 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOP08100 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOP08100 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOP08100 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOP08100 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOP08100 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOP08100 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOP08100 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOP08100 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOP08100 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOP08100 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOP08100 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOP08100 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOP08100 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOP08100 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOP08100 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOP08100 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOP08100 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOP08100 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOP08100 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOP08100 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOP08100 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOP08100 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOP08100 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOP08100 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOP08100 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOP08100 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOP08100 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOP08100 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOP08100 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOP08100 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOP08100 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOP08100 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOP08100 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOP08100 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOP08100 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOP08100 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOP08100 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOP08100 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOP08100 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOP08100 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOP08100 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOP08100 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RHOP08100 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOP08100 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOP08100 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOP08100 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOP08100 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RHOP08100 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms