Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFMP07197 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFMP07197 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFMP07197 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFMP07197 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFMP07197 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFMP07197 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFMP07197 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFMP07197 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFMP07197 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFMP07197 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFMP07197 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFMP07197 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFMP07197 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFMP07197 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFMP07197 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFMP07197 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFMP07197 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFMP07197 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFMP07197 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFMP07197 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFMP07197 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFMP07197 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFMP07197 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFMP07197 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFMP07197 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFMP07197 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFMP07197 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFMP07197 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFMP07197 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFMP07197 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFMP07197 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFMP07197 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFMP07197 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFMP07197 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFMP07197 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFMP07197 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFMP07197 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFMP07197 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFMP07197 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFMP07197 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFMP07197 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFMP07197 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFMP07197 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFMP07197 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFMP07197 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFMP07197 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFMP07197 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFMP07197 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFMP07197 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFMP07197 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFMP07197 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFMP07197 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFMP07197 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFMP07197 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFMP07197 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFMP07197 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFMP07197 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFMP07197 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFMP07197 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFMP07197 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFMP07197 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFMP07197 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFMP07197 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFMP07197 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFMP07197 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFMP07197 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFMP07197 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFMP07197 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFMP07197 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFMP07197 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFMP07197 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFMP07197 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFMP07197 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEFMP07197 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFMP07197 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFMP07197 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFMP07197 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFMP07197 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFMP07197 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFMP07197 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFMP07197 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFMP07197 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFMP07197 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFMP07197 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFMP07197 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFMP07197 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFMP07197 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFMP07197 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFMP07197 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFMP07197 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFMP07197 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFMP07197 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFMP07197 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFMP07197 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEFMP07197 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NEFMP07197 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEFMP07197 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEFMP07197 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEFMP07197 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms