Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APODP05090 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APODP05090 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
APODP05090 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APODP05090 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APODP05090 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APODP05090 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APODP05090 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APODP05090 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APODP05090 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APODP05090 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APODP05090 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APODP05090 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APODP05090 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APODP05090 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APODP05090 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APODP05090 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APODP05090 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APODP05090 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APODP05090 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APODP05090 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APODP05090 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APODP05090 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APODP05090 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APODP05090 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APODP05090 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APODP05090 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APODP05090 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APODP05090 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
APODP05090 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APODP05090 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APODP05090 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APODP05090 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APODP05090 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APODP05090 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
APODP05090 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APODP05090 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APODP05090 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APODP05090 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APODP05090 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APODP05090 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APODP05090 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APODP05090 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APODP05090 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APODP05090 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APODP05090 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APODP05090 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APODP05090 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APODP05090 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APODP05090 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APODP05090 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APODP05090 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APODP05090 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APODP05090 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APODP05090 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APODP05090 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
APODP05090 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APODP05090 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APODP05090 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APODP05090 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APODP05090 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APODP05090 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
APODP05090 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
APODP05090 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
APODP05090 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APODP05090 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APODP05090 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
APODP05090 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APODP05090 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APODP05090 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APODP05090 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APODP05090 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APODP05090 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APODP05090 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APODP05090 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APODP05090 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
APODP05090 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APODP05090 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APODP05090 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
APODP05090 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APODP05090 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
APODP05090 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APODP05090 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APODP05090 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APODP05090 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APODP05090 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APODP05090 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APODP05090 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APODP05090 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APODP05090 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APODP05090 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APODP05090 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APODP05090 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APODP05090 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APODP05090 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APODP05090 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APODP05090 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APODP05090 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APODP05090 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APODP05090 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms