Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UFL1O94874 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UFL1O94874 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UFL1O94874 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UFL1O94874 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UFL1O94874 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UFL1O94874 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UFL1O94874 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UFL1O94874 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UFL1O94874 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UFL1O94874 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UFL1O94874 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UFL1O94874 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UFL1O94874 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UFL1O94874 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UFL1O94874 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UFL1O94874 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UFL1O94874 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UFL1O94874 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UFL1O94874 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UFL1O94874 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UFL1O94874 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UFL1O94874 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UFL1O94874 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UFL1O94874 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UFL1O94874 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UFL1O94874 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UFL1O94874 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UFL1O94874 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UFL1O94874 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UFL1O94874 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UFL1O94874 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UFL1O94874 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UFL1O94874 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
UFL1O94874 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UFL1O94874 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
UFL1O94874 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
UFL1O94874 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UFL1O94874 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UFL1O94874 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UFL1O94874 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UFL1O94874 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UFL1O94874 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UFL1O94874 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UFL1O94874 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UFL1O94874 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UFL1O94874 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UFL1O94874 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UFL1O94874 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UFL1O94874 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UFL1O94874 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UFL1O94874 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UFL1O94874 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UFL1O94874 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UFL1O94874 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UFL1O94874 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UFL1O94874 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UFL1O94874 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UFL1O94874 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UFL1O94874 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UFL1O94874 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UFL1O94874 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UFL1O94874 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UFL1O94874 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UFL1O94874 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFL1O94874 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFL1O94874 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
UFL1O94874 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFL1O94874 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFL1O94874 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFL1O94874 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFL1O94874 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFL1O94874 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFL1O94874 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFL1O94874 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFL1O94874 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFL1O94874 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFL1O94874 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFL1O94874 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFL1O94874 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFL1O94874 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFL1O94874 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFL1O94874 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFL1O94874 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFL1O94874 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFL1O94874 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFL1O94874 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFL1O94874 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFL1O94874 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFL1O94874 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
UFL1O94874 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFL1O94874 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFL1O94874 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UFL1O94874 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UFL1O94874 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UFL1O94874 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UFL1O94874 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UFL1O94874 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UFL1O94874 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UFL1O94874 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms